小青柑制作工艺流程为：摘果、洗果、干燥、切帽、取肉、晾晒、入茶、干晒，制作后的小青柑果皮青绿富有光泽，油室分布均匀而密集，闻起来味道微辛，清香，其口感醇滑润甜，果香味丰富。
1、采摘
人工采摘及筛选采果，精选油室饱满，香气馥郁，果品均匀的新会茶枝柑。
2、洗果
多次清洗新鲜新会柑，确保小青柑的干净卫生。
3、筛果
不同直径大小的小青柑分级别筛选，统一每个级别的果实大小，避免成品大小参差不齐。
4、挖果
在柑果顶部切一个圆形切口，通过切口取出果肉，将柑果内部掏空且在果品底部开挖透气孔。
挖果后再次用净水清洗，保证柑普茶的安全卫生，且果腹内一定不能残留果肉。
5、风干
让鲜果壳在暖阳底下慢慢地脱干水分。
6、入茶
手工将云南的普洱茶填入掏空备用的柑果腹中，并人工压实果腹内的茶叶。
7、杀青
把填好茶叶的小青柑进行杀青，主要是为了去掉青柑果的涩味。
8、半生晒工艺
将填好茶的柑果放在太阳底下晒若干天后，再由专业制茶师将它们放入烘焙室，使茶与柑的香气、活性物质相互渗透，相得益彰。
9、陈化
柑普茶风干后，经专业技师进行检验后放入恒温室进行陈化工艺，一杯和、润、甘、甜的柑普茶就诞生了。
注：小青柑的制作还分为低温烘焙工艺、半生晒工艺和全生晒工艺。